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Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  31 lines
  1. *****************************
  2. * Cecropin family signature *
  3. *****************************
  4.  
  5. Cecropins [1,2,3] are  potent  antibacterial  proteins  that constitute a main
  6. part of the cell-free immunity of insects.     Cecropins are small proteins of
  7. about 35  amino  acid  residues  active  against  both gram-positive and gram-
  8. negative bacteria. They seem to exert a lytic action on bacterial membranes.
  9.  
  10. Cecropins isolated  from  insects other  than Cecropia have been given various
  11. names: bactericidin, lepidopteran,  sarcotoxin, etc. All of these peptides are
  12. structurally related.    Cecropin P1, an intestinal antibacterial peptide from
  13. pig, also belongs to this family.
  14.  
  15. As  a signature  pattern for  this  family of  active  peptides, we selected a
  16. conserved region in the N-terminal section of cecropins.
  17.  
  18. -Consensus pattern: W-x(0,2)-[KDN]-x(2)-K-[KRE]-[LI]-E-[RKN]
  19. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  20. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: Equine Infectious Anemia virus  gag
  21.  polyprotein and  Streptococcus  cinnamonensis  methylmalonyl-CoA mutase beta-
  22.  subunit.
  23. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  24.  
  25. [ 1] Boman H.G., Hultmark D.
  26.      Annu. Rev. Microbiol. 41:103-126(1987).
  27. [ 2] Boman H.G.
  28.      Cell 65:205-207(1991).
  29. [ 3] Boman H.G., Faye I., Gudmuundsson G.H., Lee J.-Y., Lidholm D.-A.
  30.      Eur. J. Biochem. 201:23-31(1991).
  31.